西は国制岳を経て海岸部まで連続し、南はモッチョム岳、東は愛子岳へ通じる山稜部を含む区域である。指定地域の面積は107.5k?uで、島の総面積の21.3％にあたる。指定地域は、国有林が95.5％を占め、西部の海岸部の一部は私有地である。

指定地域の大部分は、原生自然環境保全地域、国立公園の特別地域及び特別保護地区、森林生態系保護地域でもある（図表4）。また、屋久島スギ原始林が特別天然記念物、アカヒゲ、カラスバト、アカコッコ、イイジマムシクイが天然記念物の指定を受ける。

図表4 世界遺産区域

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